Consejo de Administración
Es el Órgano de Gobierno de este Organismo Descentralizado, integrado por 16 miembros, Consejeros del Sector Público, Privado, Académico y Ciudadano.
Este Órgano sesiona ordinariamente al menos seis veces al año, y extraordinariamente cuando así se convoque. Todas sus sesiones deberán ser públicas y transmitirse en vivo, vía electrónica.

Presidente del Consejo de Administración

Director Ejecutivo
Es quien representa legalmente a la Junta Central ante las autoridades, dentro de sus facultades se encuentra: suscribir y formalizar a nombre de la Junta Central y Organismos Operadores, Acuerdos, Contratos, Convenios y demás actos jurídicos con la Federación, Municipios y Organismos Nacionales e Internacionales, supervisar la aplicación de Programas Federales y Estatales en materia de agua, así como, supervisar a los Organismos Operadores.
Integrantes del Consejo de Administración

Dr. Oscar Fidencio Ibáñez Hernández
Presidente del Consejo de Administración

Lic. César Gustavo Jáuregui Moreno

Lic. José de Jesús Granillo Vázquez

Arq. Carlos Aguilar García

Ing. Gabriel Martin Valdez Juárez

Ing. Mauro Parada Muñoz

Dr. Felipe Fernando Sandoval Magallanes
Secretaría de Salud

Mtro.José Ángel Felix Sánchez

Ing. Mario Mata Carrasco

Lic. Roberto Anaya Moreno
Secretario del Consejo (Titular de la Dirección Jurídica)

C.p. Horacio Granados Gómez

Ing. Manuel de la Mora Prieto

Dip. Edgar José Piñón Domínguez
Poder Legislativo del Estado, quien ocupe la Presidencia de la Comisión Legislativa en la materia del Agua

Lic. Luis Antonio Corral Pérez

Ing. Juan Carlos Sapién de Anda

Dr. Victor Manuel Reyes Gómez
Representante del Sector Académico y/o de Investigación